《藥師經》，全名《藥師琉璃光如來本願功德經》，是讚歎藥師佛行願的大乘經典之一。

藥師佛全名藥師琉璃光如來，是東方淨琉璃世界教主；以琉璃為名，乃取琉璃之光明透徹，以喻國土清淨無染。

藥師如來有日光遍照與月光遍照菩薩為左右協侍，稱作「東方三聖」。

藥師佛於過去久遠劫修梵行，在電光如來住世時，曾發十二大願，願為眾生解除疾苦，使眾生具足諸根，身相端正，資具豐饒，離諸橫難等，並導入解脫。

眾生身心煩惱多，尤其貪、瞋、癡三毒，產生八萬四千種煩惱；心理困苦，導致生理四百四種疾病，使身心受病苦折磨。

藥師佛願幫助眾生消除這些煩惱，使人人免於疾病纏身，消減痛苦，滅除災難。

一九六六年，佛教克難慈濟功德會成立，農曆每個月二十四日舉行發放，初稱為「慈濟法會」。後因感念發心響應竹筒歲月、點滴捐助的大德， 上人打破「不趕經懺、不誦經」的原則，發願於靜思精舍每個月發放時誦一部《藥師經》，期勉眾人牢記藥師十二大願，並時時實踐自救救人、自度度人的宏願，後改稱為「藥師法會」，這是慈濟與「藥師法會」的因緣。

在現代，知道藥名、會配方就稱為「藥師」。但在佛的時代，佛不但能應病下藥，還能洞察天地之間的四大不調，剖析人的心病，所以敬稱佛為大醫王或大藥師。其實藥就是法，只要懂得用，人間處處是良藥，信手拈來都是妙方！

而此藥師經講述即是二○○一年七月至二○○二年七月，時跨千禧年時， 上人感於倫理道德失序，人際間關係緊張，充滿對立、衝突、紛爭，故在早課時間闡述《藥師經》的內容結集。

上人謙稱以伴讀方式逐句講解，終至眾人明瞭整本經文意義為主。無疑是 上人針對現代人的身心病態，為達天下祥和的目標，弘揚人性光明的品德，所下的一帖救世良方。